Syllabus data

Course Title
Physical biology 3
Course Title in English
Physical biology 3
Course Type
Major Courses
Eligible Students
School of Science
Target Grade
3Year
Course Numbering Code
HSSBA3MCA1
Credits
2.00Credits
The course numbering code represents the faculty managing the subject, the department of the target students, and the education category (liberal arts / specialized course). For detailed information, please download the separate manual from the upper right 'question mark'.
Type of Class
講義 (Lecture)
Eligible Year/Semester
Spring semester 2026
Instructor
久保 稔
Affiliation
理学部
Language of Instruction
Japanese
Related SDGs
9
Office Hours and Location
授業終了後の講義室
Contact
minoru@sci.u-hyogo.ac.jp

Corresponding Diploma Policy
A double circle indicates the most relevant DP number and a circle indicates the associated DP.
Corresponding Undergraduate School DP
2◎/10◎/11◎
Corresponding Graduate School DP
Corresponding University-Wide DP
1-1◎/1-2◎/4-1◎
Academic Goals of Teacher Training Course

Course Objectives and Learning Outcome
【講義目的】タンパク質が機能する際のダイナミクスを原子・電子のレベルで解析するための手法を学び、動的な構造生物学や生物物理学の研究を進めるための基礎知識を習得することが、本講義の目的である。
【到達目標】タンパク質というナノマシンの設計原理を理解するためには、タンパク質のダイナミクスを解析する必要がある。そのための解析手法を原理から説明できるようになる。
Subtitle and Keywords of the Class
キーワード:反応速度論、連続フロー法、ストップトフロー法、ポンププローブ法、表面プラズモン共鳴、アロステリック効果、分子軌道、スペクトル、電子遷移、振動遷移、赤外線吸収、ラマン散乱、一分子計測、高速AFM
Course Overview and Schedule
【講義内容】本講義ではタンパク質の構造とダイナミクスに関する序論を述べた後、分光学を中心に生物物理学的研究手法を説明する。
【授業計画】
(イントロダクション)
1. タンパク質の構造とダイナミクス
(分光学序論)
2. 光と物質の相互作用
3. 分子軌道と電子遷移
(電子分光)
4. 電子分光の基礎
5. タンパク質の電子スペクトル
(振動分光)
6. 振動分光の基礎
7. 赤外線吸収
8. ラマン散乱
9. タンパク質の振動スペクトル
(反応速度論と高速反応の観測)
10. タンパク質とリガンドの相互作用解析
11. タンパク質の速度論解析
12. 反応中間体を捉える時間分解測定技術1
13. 反応中間体を捉える時間分解測定技術2
(その他の生物物理学的手法)
14. 一分子計測
15. 高速AFM
定期試験

*パソコンの利用:毎回の課題提出はユニバーサルパスポート上で行うため、ノートPCまたはタブレット等の入力可能な端末を持参すること。
In-person/Remote Classification
In-person
Implementation Method and Remote Credit Limit Application
・対面授業のみ
・遠隔授業単位上限の適用を受けない
Uses of Generative AI
Limited permission for use
Precautions for using Generative AI
生成AIの利用にあたっては『本学の教育における生成AIの取扱いについて(学生向け)』の記載内容について留意すること。この授業においては、以下の範囲において、生成AIの利用を許可し、これ以外の範囲での利用は禁止する。生成AIの利用については担当教員の指示に従うこと。教員が認める範囲を超えて生成AIを利用したことが判明した場合は、単位を認定しない、又 は認定を取り消すことがある。生成AIの出力した内容について、事実関係の確認や出典・参考文献を確認・追記することが重要である。また、生成AIによる出力結果をそのまま課題・レポートとして提出してはならない。

<利用可の範囲>
予習・復習において、講義プリントの内容理解を補助する利用
*授業における課題作成時の生成AIの利用は認めない。
Textbook
講義ノートをユニバーサルパスポートで配布する。ダウンロードして打ち出しておくこと。
References
生命科学のための物理化学15講 巧刀滋・内藤晶著 講談社
生物物理化学 Alan Cooper著 化学同人
生体分子分光学入門 尾崎幸洋・岩崎秀夫著 共立出版
分光学への招待 尾崎幸洋著 産業図書

Contents and Estimated Time for Pre- and Post- Learning (Preparation and Review)
【予習】講義プリントをダウンロードし、授業前に目を通しておくこと(30h)。
【復習】講義プリントや参考文献を読んで、内容の理解を定着させること(30h)。
Contents of Active Learning
採用しない。
Grading Criteria and Methods
【成績評価の基準】講義目的・到達目標への到達度に基づき、合格者には、S(90点以上)、A(80点以上)、B(70点以上)、C(60点以上)による成績評価を行う。
【成績評価の方法】定期試験(85%)及び課題提出(15%)で評価する。

How to Disclose Assignments and Exam Results
課題:優れたものや履修者の間で共有すべき内容のものがあれば講義の中で紹介する。
定期試験:授業評価アンケートの教員コメント欄に試験結果に関するコメントもあわせて記載する。
Precautions and Requirements for Course Registration
Practical Education
該当しない。
Remarks
In cases where any differences arise between the English version and the original Japanese version, the Japanese version shall prevail as the official authoritative version.