Analysis of Biosupramolecular Structure

Course Title

Course Title in English

Analysis of Biosupramolecular Structure

Course Type

-

生命科学専攻・生体物質構造解析学・選択科目

Eligible Students

Graduate School of Science

Target Grade

1Year

Course Numbering Code

HSSML5MCA1

Credits

2.00Credits

The course numbering code represents the faculty managing the subject, the department of the target students, and the education category (liberal arts / specialized course). For detailed information, please download the separate manual from the upper right 'question mark'.

Type of Class

講義 (Lecture)

Eligible Year/Semester

Fall semester 2026

Instructor

村本和優

Affiliation

理学研究科

Language of Instruction

Japanese

Related SDGs

9

Office Hours and Location

随時・研究2期棟S206号室

Contact

ユニパの授業Q&Aにより事前連絡

Corresponding Diploma Policy

A double circle indicates the most relevant DP number and a circle indicates the associated DP.

Corresponding Undergraduate School DP

ー

Corresponding Graduate School DP

1◎／6〇

Corresponding University-Wide DP

N/a

Academic Goals of Teacher Training Course

ー

Course Objectives and Learning Outcome

【講義目的】生体超分子の構造と機能に関する研究、および構造解析法の現状について理解する。
【到達目標】生体超分子の構造を表現し、機能を説明する。タンパク質複合体の構造解析法、およびタンパク質構造の特徴を挙げる。

Subtitle and Keywords of the Class

サブタイトル：　エネルギー変換系膜タンパク質複合体構造解析
キーワード：　呼吸鎖タンパク質複合体構造、X線結晶解析、構造機能相関

Course Overview and Schedule

【講義内容】生体超分子としてのエネルギー変換系膜タンパク質複合体の構造例とそれらの機能、構造解析法（おもにX線結晶解析）、およびタンパク質構造の特徴について解説する。
【授業計画】
1.　エネルギー変換系の膜タンパク質複合体
2.　タンパク質の発現、精製、結晶化法
3.　構造解析法（光学顕微鏡、電子顕微鏡、X線結晶解析）
4.　X線結晶解析（回折、波の干渉）
5.　X線結晶解析（X線回折、構造因子）
6.　X線結晶解析（結晶の構造因子）
7.　X線結晶解析（位相の決定、電子密度、構造精密化）
8.　低温電子顕微鏡単粒子解析
9.　構造の特徴（分子表面、静電的相互作用、pKa解析）
10.　構造の特徴（水素結合、金属原子、溶媒と脂質分子、構造変化）
11.　生体超分子システム（ATP合成系）
12.　生体超分子システム（細菌運動系）
13.　生体超分子の構造と機能（ポンプ、能動輸送体、チャネル、トランスポーター）
14.　課題学習（構造データベース（Protein Data Bank）の利用とプレゼンテーション）
15.　課題学習（まとめ）

In-person/Remote Classification

In-person

Implementation Method and Remote Credit Limit Application

対面授業のみ（パソコン、大画面モニターを使用する。プリントを配布する。）
遠隔授業単位上限の適用を受けない

Uses of Generative AI

Limited permission for use

Precautions for using Generative AI

生成ＡＩの利用にあたっては『本学の教育における生成ＡＩの取扱いについて（学生向け）』の記載内容について留意すること。課題学習の作品、レポートの作成には生成AI の利用不可。

Textbook

授業時に配布されるプリント
関連Webサイト

References

「生体高分子結晶のX線構造解析」(2022) 竹中章郎他（丸善出版）
「タンパク質のX線結晶解析法　第2版」(2008) J. Drenth (シュプリンガー・ジャパン)
「クライオ電子顕微鏡ハンドブック」(2023) 難波啓一他（NTS）
“Bioenergetics 4” (2013) D. G. Nicholls and S. J. Ferguson (Academic Press)
「タンパク質の構造入門　第2版」(2000) C. Branden & J. Tooze (Newton Press)

Contents and Estimated Time for Pre- and Post- Learning (Preparation and Review)

【事前学習】各回の授業計画と関連する参考⽂献中の内容を予習する。（20h）
【事後学習】各回の授業内容を復習し、指⽰された課題に取り組む。（40h）

Contents of Active Learning

採⽤しない

Grading Criteria and Methods

【成績評価の基準】
（1）成績は100 点満点とし、60 点以上をもって合格とする。
（2）合格者には所定の単位を与える。
（3）合格者の成績は、講義目的・到達目標に記載する能⼒の到達度に基づき、S(90点以上), Ａ(80点以上), B(70点以上), C(60点以上)の評語をもって表す。
【成績評価の⽅法】
課題（80%）、および確認テスト（20%）を基準として総合的に評価する。

How to Disclose Assignments and Exam Results

課題については、授業時もしくはユニバーサルパスポートでコメントする。

Precautions and Requirements for Course Registration

Practical Education

該当しない

Remarks

In cases where any differences arise between the English version and the original Japanese version, the Japanese version shall prevail as the official authoritative version.

Syllabus data