Physical biology 1 ｜ Syllabus data

Course Title

Physical biology 1

Course Title in English

Physical biology 1

Course Type

Major Courses／Teacher training courses

ー

Eligible Students

School of Science

Target Grade

2Year

Course Numbering Code

HSSBA2MCA1

Credits

2.00Credits

The course numbering code represents the faculty managing the subject, the department of the target students, and the education category (liberal arts / specialized course). For detailed information, please download the separate manual from the upper right 'question mark'.

Type of Class

講義 (Lecture)

Eligible Year/Semester

Fall semester 2026

Instructor

柴田直樹

Affiliation

理学部

Language of Instruction

Japanese

Related SDGs

9

Office Hours and Location

10:00〜17:00
生体物質構造学Ｉ分野（研究棟３０４号室）

Contact

shibach@sci.u-hyogo.ac.jp

Corresponding Diploma Policy

A double circle indicates the most relevant DP number and a circle indicates the associated DP.

Corresponding Undergraduate School DP

1◎／2◎／9◎

Corresponding Graduate School DP

ー

Corresponding University-Wide DP

1-1◎／1-2◎

Academic Goals of Teacher Training Course

Ability to keep polishing

Course Objectives and Learning Outcome

【講義目的】
生物物理学は物理学・物理化学的手法により生体分子や生命現象を理解するための学問分野である。生物物理学の研究分野は非常に幅広く、研究対象や研究方法が多岐にわたっているが、本講義では生物物理学の中で特に重要なテーマである生体高分子の構造構築原理や構造の特徴、立体構造解析の方法および基礎理論について解説することを目的とする。
【到達目標】
１）タンパク質の立体構造の構築原理、タンパク質の立体構造の特徴と機能との相関を説明できること、２）立体構造解析の基礎理論を説明すること、を到達目標とする。

Subtitle and Keywords of the Class

キーワード：タンパク質立体構造の構築原理、タンパク質の構造解析、構造生物学

Course Overview and Schedule

【講義内容】
生体高分子の立体構造はそれらの機能と密接に関わっている。本講義では、まず生体高分子の種類とそれぞれの立体構造の特徴を述べると共に立体構造解析の重要性と意義について解説する。そして構造解析するための手法をあげ、それらの相違と共通点を述べることにより立体構造解析の概念を解説する。その後、Ｘ線結晶構造解析法の基礎的な理論を説明する。

【授業計画】
１．生体高分子の働き　「Essential 細胞生物学第４章」
２．タンパク質の構成要素と分子内相互作用　「Essential 細胞生物学第４章」
３．タンパク質の折り畳み　「Essential 細胞生物学第４章」
４．タンパク質を構成する基本構造　「Essential 細胞生物学第４章」
５．タンパク質の折り畳みと安定性に関するエネルギー論　「配布資料」
６．タンパク質の構造の階層性　「Essential 細胞生物学第４章」
７．タンパク質の高次構造　「Essential 細胞生物学第４章」
８．タンパク質の働く仕組み　「Essential 細胞生物学第４章」
９．酵素の構造と機能　「Essential 細胞生物学第４章」
１０．タンパク質の研究方法ー１（試料調製方法）「Essential 細胞生物学第４章」
１１．タンパク質の研究方法ー２（構造解析方法）「Essential 細胞生物学第４章」
１２．生体高分子の構造解析法の比較　「配布資料」
１３．X線結晶構造解析法による生体高分子の構造解析法の原理−１　「配布資料」
１４．X線結晶構造解析法による生体高分子の構造解析法の原理−２　「配布資料」
１５．章末問題等の解説　「Essential 細胞生物学第４章」
定期試験
※パソコンの利用：なし

In-person/Remote Classification

In-person

Implementation Method and Remote Credit Limit Application

・対面授業のみ
・遠隔授業単位上限の適用を受けない

Uses of Generative AI

Limited permission for use

Precautions for using Generative AI

生成AIの利用にあたっては『本学の教育における生成AIの取扱いについて(学生向け)』の記載内容について留意すること。
この授業においては、以下の範囲において、生成ＡＩの利用を許可し、これ以外の範囲での利用は禁止する。生成ＡＩの利用については担当教員の指示に従うこと。教員が認める範囲を超えて生成ＡＩを利用したことが判明した場合は、単位を認定しない、又は認定を取り消すことがある。生成ＡＩの出力した内容について、事実関係の確認や出典・参考文献を確認・追記することが重要である。また、生成ＡＩによる出力結果をそのまま課題・レポートとして提出してはならない。
＜利用可の範囲＞
講義資料の要約、課題・レポート文案作成、数式の計算等

Textbook

「Essential 細胞生物学　原書第５版」，南江堂（生協等で購入する）

References

参考文献
「ヴォート生化学」、東京化学同人
「タンパク質のX線結晶解析法」 J. ドレント著、シュプリンガージャパン
「これならわかるＸ線結晶解析」、化学同人
「アトキンス　生命科学のための物理化学」東京化学同人
「バーロー　物理化学（上）」東京化学同人

Contents and Estimated Time for Pre- and Post- Learning (Preparation and Review)

【予習】授業に際して指示するテキスト・オンデマンド教材の部分を事前読み込み（30ｈ）

【復習】講義内容の理解を深め定着させるためにテキスト・オンデマンド教材を読み直し（15ｈ）、テキストの問題を解く（15ｈ）

Contents of Active Learning

採用しない

Grading Criteria and Methods

【成績評価の基準】
生体高分子の立体構造の構築原理や特徴、機能との相関、構造解析の方法や理論について理解したものに単位を授与する。
講義目的・到達目標に記載する能力（知識・技能、思考力、判断力、表現力等）の到達度に基づき、S（90点以上）、Ａ（80点以上）、B（70点以上）、C（60点以上）による成績評価のうえ、単位を付与する。
【成績評価の方法】
定期試験により成績を評価する。

How to Disclose Assignments and Exam Results

授業評価アンケートの教員コメント欄に試験結果に関するコメントもあわせて記載する。

Precautions and Requirements for Course Registration

・毎回事前に配布する講義資料やテキストの該当箇所について、十分な予習・復習をして講義に出席すること。
・第１３回および第１４回の講義では、高校数学（ベクトル、三角関数、数列、積分）を事前に理解しておくことが必要である。該当する講義資料についての予習の他、必要に応じて高校数学の該当箇所を事前に確認しておくこと。

Practical Education

該当しない

Remarks

In cases where any differences arise between the English version and the original Japanese version, the Japanese version shall prevail as the official authoritative version.